Канатбек Жайсанбаев родился 8 февраля 1980 года. В 2000 году он окончил Казахскую государственную юридическую академию по специальности юрист, а в 2012 году получил степень бакалавра экономики и бизнеса в Казахском экономическом университете имени Т. Рыскулова.
Трудовую деятельность начал в 2000 году преподавателем в Кызылординском филиале Казахской государственной юридической академии. Позже работал в системе судебного администрирования Кызылординской области, в аппарате акима области и в Министерстве чрезвычайных ситуаций.
С 2008 по 2016 год занимал должности заместителя руководителя и руководителя аппарата акима Кызылординской области. С октября 2016 года перешёл в Администрацию Президента, где работал государственным инспектором и заместителем заведующего отделом.
В апреле 2021 года его назначили заведующим отделом государственного контроля и организационно-территориальной работы. С декабря 2022 года он занимал пост помощника Президента — заведующего Отделом по контролю за рассмотрением обращений, а с 1 сентября 2023 года — заведующего этим отделом.
Канатбек Жайсанбаев награждён орденами «Құрмет» и «Парасат», а также памятными медалями.